鸽Ⅰ型副粘病毒的分离鉴定及其F基因、HN基因的序列分析

【作者】 陈钟鸣； 刘怀然； 孙敏华； 戴鼎震； 张志成； 方光远； 孔宪刚；

【机构】 金陵科技学院动物科学与技术学院； 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所；

【摘要】 利用RT-PCR技术,将从江苏省分离到的2株鸽源NDV的融合蛋白(F)和血凝素神经氨酸酶(HN)基因重要功能区片断进行扩增和序列分析,发现F蛋白多肽裂解位点的氨基酸序列为112K-R-Q-K-R-F117,符合NDV强毒株序列特点.F基因分型及同源性比较显示:分离到的2株鸽源NDV PG-CH-JS-1-05,PG-CH-JS-1-06属基因Ⅵ型.与国内参考毒株YN-P1F基因推导的氨基酸序列同源性最高为96.4%.与LaSota的同源性为84.1%-84.2%,与F48E9的同源性为86.0%-86.2%;与国外参考毒株Warwick66的同源性为92.7%-93.3%;HN基因氨基酸序列同源性比较显示:与PB9601的同源性最低,只有3.4%-3.7%,与LaSota的同源性也较低,为88.5%-88.7%。而与国外参考毒株IT-227-82的氨基酸序列同源性为95.4%-95.6%,与Pigen-NY-US-1984的同源性为94.8%.94.9%,与248 V B的同源性为92.5%-92.7%,说明与国外鸽源NDV分离毒株的遗传距离较近。更多还原