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猪感染口蹄疫亚洲Ⅰ型病毒VP1基因的克隆及其二级结构和B细胞抗原表位预测
【作者】 杨鑫； 王红宁； 罗昊； 邹立扣； 曾博； 谢波；
【机构】 四川大学生命科学学院四川大学动物疾病防控生物工程研究中心,四川大学"985"工程西南资源环境与灾害控制科技创新平台；
【摘要】 对一株猪源口蹄疫亚洲Ⅰ型毒株的主要抗原基因VP1进行了扩增和测序,并与国内外报道序列进行比对,发现与国内报道株同源性在83.3%-86.4%之间。采用Garnier-Robso法、Chou-Fasman法、Karplus-Schultz法对VP1序列进行二级结构分析,采用Kyte-Doolittle法分析氨基酸序列亲水性、Emini法预测特定区域位于蛋白质表面的可能性、Jameson-Wolf法预测各结构蛋白的抗原指数,最后获得VP1结构蛋白的B细胞抗原表位.与国内报道序列的二级结构的分析和比较,发现该株病毒VP1基因的抗原表位区域具有一定的差异。
【基金】 项目基金：“十一五”国家科技支撑计划“规模化猪场和养殖小区生物安全控制技术研究与示范;“荣昌猪健康养殖生物安全控制技术研究与示范”(课题编号分别为：2007BAD51B05；2006BAD14B05-05)
- 【会议录名称】 中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会论文集
- 【会议名称】中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会
- 【会议时间】2008-09
- 【会议地点】中国辽宁大连
- 【分类号】S858.28
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会动物传染病学分会