鹅呼肠孤病毒GRV1株分离鉴定及其σC基因特征性分析

【作者】 张云； 欧阳岁东； 刘明； 胡奇林； 郎景华； 韩周；

【机构】 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所生物技术国家重点实验室； 福建农科院牧医所； 哈尔滨市兽医卫生防疫站；

【摘要】 从患运动障碍的雏鹅肝脏和脾脏分离到一株鹅源呼肠孤病毒,该病毒经琼脂扩试验可与番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的抗血清发生交叉反应,推测其为呼肠孤病毒,命名为GRV1。参考GenBank禽呼肠孤病毒(Avian Reovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒(Muscovy Duck Reovirus,MDRv)小外壳蛋白(minor core protein)σC蛋白基因序列设计合成了一对引物,病毒RNA经RT-PCR扩增,产物为810 bp,与预期的目的片断大小一致,测序,σC基因在280-1089区间是一个开放性阅读框架(ORF),编码269个氨基酸的蛋白,GC含量为49.88%,等电点为6.497,分子量为29.4ku。核苷酸序列经DNASTAR(6.0)软件分析,与法国番鸭呼肠孤病毒89330株核苷酸同源率为93.0%,与鸡呼肠孤病毒σC基因同源率仅为21%-25%,同源性分析表明鹅呼肠孤病毒与番鸭呼肠孤病毒可能来自同一祖先,建议将鹅呼肠孤病毒连同番鸭呼肠孤病毒归属为正呼肠孤病毒属第二个亚群中不同于禽和内尔森贝海湾呼肠病毒独立基因群。由蛋白质分析软件Anthepro 5.0和MultiCoil软件分析表明,抗原区多位于N末端,没有跨膜区,σC为三股螺旋结构,这是我国第一次在鹅体内分离到呼肠孤病毒,同时也是第一次在数据库中提供σC的序列。更多还原