马传染性贫血病毒弱毒疫苗及其亲本强毒L株前病毒核苷酸序列比较分析

【作者】 王柳； 童光志； 刘红全； 杨志彪； 仇华吉； 孔宪刚； 王玫；

【机构】 中国农科院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室；

【摘要】 以马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒疫苗株(EIAV DLA)感染细胞DNA及其亲本强毒L株感染马外周血白细胞DNA为模板,PCR扩增EIAV DLA和L株前病毒,扩增产物克隆后测序。结果DLA株前病毒基因组全长8266bp,L株为8235bp。DLA株与L核苷酸同源率为97.0％。DLA和L株相比,长末端重复序列(LTR,由U3、R、U5组成)、囊膜基因env及ORF S2变异很高,U3、R、U5、env及ORF S2核苷酸差异分别达13.2％、7.5％、5.1％、2.7％和3.9％,env基因及ORF S2氨基酸序列差异分别为4.4％和8.8％。我们从EIAV高度变异的env各毒株中鉴定出六个保守区,并发现中国EIAV强、弱毒增强子区(ENH)有转录因子GATA结合序列,L比DLA株多两个N—连接糖化位点。DLA和L、DA株在ENH的主要差别是,DLA株含有转录因子bHLH作用序列,且TAR茎部发生了改变,形成一胸腺嘧啶突起。更多还原