抗真菌物质与酵母细胞作用后全基因表达谱的聚类法分析

【作者】 张岩； 张亮； 周一鸣； 安爽； 果德安； 周玉祥； 曾令文； 程京；

【机构】 清华大学生物技术与科学系； 生物芯片北京国家工程研究中心； 北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室；

【摘要】 <正> 微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况,它为研究药物作用机制提供了一个新的高效技术平台。这里我们报道了用9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞,并得到酵母细胞的全基因表达谱,然后采用Average Linkage Clustering算法对其进行聚类分析(图2)。聚类分析后发现,能与细胞膜上的麦角固醇结合形成膜穿孔,引起胞内营养物质泄漏而导致细胞死亡的两性霉素B和制霉菌素被聚类在一组,能抑制麦角固醇合成途径中的羊毛更多还原