【作者】 李成云； 刘林； 杨静； 业艳芬； 李进斌； 叶敏； 王杨； 王云月； 朱有勇；

【机构】 云南农业大学植物病理重点实验室； 云南省农业科学院植物保护研究所；

【摘要】 在对稻瘟病菌基因组中SSR 分布进行了系统分析的基础上,对由1-6 个碱基为重复单元的SSR在基因的蛋白质编码区中的分布进行了分析。结果表明, 该病原菌的2,378个基因的编码区中共分布有3,240个SSR序列(标准是15 bp以上,匹配值为80％)。在已经有注释的 4732个基因中,861个基因的编码区中有 SSR。编码区中的SSR以三碱基重复和六碱基重复为主,其它类型的SSR则很少在编码区中出现。这些SSR在基因阅读框架中的位置、基序和重复数量在这些基因中很少有保守性,表明这些基因的高度变异, 或是起源是较晚的。含有SSR的基因多为转录蛋白、信号传导的细胞调节基因这一现象表明,SSR在物种形成过程中有重要作用。在此基础上,对其中信号传导基因编码区中的SSR序列的多态性进行了试验分析。研究结果表明,基因编码区中SSR 的等位位点平均比非编码区的SSR少,但多态性丰富的SSR仍可达到10个或更多的等位位点。这些SSR既可作为分子标记使用,也同时能够提供SSR所在基因结构变化的信息。SSR变化导致的氨基酸组成的变化也是多种多样的。至于这些SSR重复次数的变化是否会影响到基因的表达和功能,还需要进一步试验。更多还原