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多肽保留时间预测
Predictio of Peptides Retention
【Author】 TANG Kailin LI Tonghua Department of Chemistry,Tongji University,Shanghai,200092,China,
【机构】 同济大学化学系;
【摘要】 <正>多肽保留时间预测有助于提高多肽鉴别的可信度以及增加正确鉴别的数目。本文利用氨基酸保留时间之和,范德华体积以及辛醇-水分配系数对多肽保留时间进行预测,采用 KPLS 进行建模预报,经过交叉验证得到很好的预测结果。
【Abstract】 Quantitative structure retention relationships(QSRR)were derived allowing prediction retention of peptides.To quantitatively characterize the structure of a peptide,the following descriptors are employed:logarithm of the sum of retention times of the amino acids composing the peptide,logarithm of Van der Waals volume of the peptide,and logarithm of its calculated n-octanol-water partition coefficient,clog P.KPLS is used to nonlinear modeling and LOO is used to verify the results.The predicted gradient retention times are in excellent agreement with the experimental data.
- 【会议录名称】 第九届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集
- 【会议名称】第九届全国计算(机)化学学术会议
- 【会议时间】2007-08
- 【会议地点】中国四川成都
- 【分类号】O629.72
- 【主办单位】中国化学会计算机化学专业委员会