连云港沿海蛤蜊科贝类rRNA基因18S-ITS1序列分析

【作者】 陈建安； 孟学平；

【机构】 淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室；

【摘要】 西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactra chinesis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)属帘蛤目蛤蜊科贝类,前者属腔蛤蜊属,后两种属蛤蜊属。这三种贝类是连云港沿海(黄海海域)的习见品种,其味道鲜美,营养丰富,是消费者喜爱的海鲜。西施舌和中国蛤蜊目前没有进行大规模人工养殖,四角蛤蜊已有人工养殖,是连云港地区水产品市场重要的经济贝类。目前,西施舌等三种贝类的繁殖生物学,核型分析、增养殖等方面的研究均有报道,利用分子手段进行的相关研究报道较少。本文利用 PCR 扩增和测序技术获得了连云港海域三种贝类核糖体 RNA 18S-ITS1-28S 区域序列。用 DNAStar 和 MEGA 3.1软件分析18S 的3′端和 ITS1的5′端部分(18S-ITS1)序列的碱基组成,进行序列比对,用 N-J 法构建系统发育树。结果显示,所扩增的西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1序列长度(去除28S 的5′端和 ITS1的3′端部分序列)分别为1052bp,1017bp,1013bp,种内序列同源性为99.0%-99.4 %,同属种间同源性为70.1%-71.1%,不同属种间同源性为44.9%-46.3%。所得 ITS1的5′端部分序列长度分别为910bp,875bp,871bp,G+C 含量(58.90%-60.23%)高于 A+T 含量,西施舌的 ITS1是目前发现的双壳贝中最长的。18S 区序列保守,种间仅存一个碱基转换位点, 空间折叠显示,此变异未引起其二级结构的改变。系统进化树显示中国蛤蜊与四角蛤蜊亲缘关系近,与西施舌的亲缘关系远,与形态学分类依据一致。此研究结果揭示,ITS1序列适于蛤蜊科内种间、特别是同属种间的分子系统发育研究,而不适于种内个体间遗传多样性分析。更多还原