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非显著序列元件对大肠杆菌启动子识别的影响

The Influence of Non-canonical Sequence Elements On E.coli Promoter Recognition

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【作者】 冉令华阮晓钢

【Author】 Ran Linghua Ruan Xiaogang (Electronic Information and Control Engineering SchoolBeijing University of Technology,Beijng 100022)

【机构】 北京工业大学电子信息与控制工程学院

【摘要】 启动子是DNA序列转录的起始信号。作为基因表达和调控所必需的重要信号,启动子的研究一直受到研究人员的关注。本文运用人工神经网络方法,并结合大肠杆菌基因分子生物学有关理论与统计事实,研究了大肠杆菌启动子中除了两个显著的保守序列外,其它几个非显著序列元件对启动子识别的影响。

【Abstract】 In this paper, a neural network method was applied to analysis the promoter non-canonical sequence elements in E.coli gene promoter. We selected different sequence length as samples to analyze the influence of different Non-canonical sequence elements. And we also used sliding windows to slide along promoter sequence. As a result, by using neural network method and E.coli gene theory, we found the non-canonical sequence elements have an influence on the promoter recognition.

【关键词】 神经网络大肠杆菌启动子
【Key words】 Neural networkEscherichia coliPromoter
【基金】 国家自然科学基金(60234020)资助项目
  • 【会议录名称】 第二十二届中国控制会议论文集(下)
  • 【会议名称】第二十二届中国控制会议
  • 【会议时间】2003-08
  • 【会议地点】中国湖北宜昌
  • 【分类号】Q75
  • 【主办单位】中国自动化学会控制理论专业委员会
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