蛋白质组质谱信息处理的关键算法研究

【作者】 孙瑞祥； 付岩； 张京芬； 李德泉； 王海鹏； 蔡津津； 王晓彪； 曾嵘； 贺思敏； 高文；

【机构】 中国科学院计算技术研究所； 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所；

【摘要】 应用质谱数据进行蛋白质的定性鉴定与定量分析是蛋白质组生物信息学研究中的一个关键问题。由于质谱仪器类型的多样化,实验过程样本中混入杂质的干扰,不同实验室质谱实验参数的不同选取,实验人员的操作水平,以及人们目前对于离子碎裂机理的认识不足等多种因素的影响,质谱数据成为一类含有多种来源噪声干扰,谱峰强度分布规则不强的复杂的大规模数据。蛋白质组学中对于质谱数据的有效信息处理算法需求,为生物信息学领域提出了新的研究问题。本文将详细介绍我们应用统计学习理论、优化方法和模式识别算法等信息处理技术,来解决蛋白质鉴定、定量蛋白质组学与疾病蛋白质组学中基于质谱数据的信息处理算法研究,主要包括串联质谱的鉴定、质谱中同位素峰信息的利用、应用质谱寻找疾病标记物和蛋白质组定量分析等关键算法。更多还原