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23种固氮蓝细菌的ITS间隔区的PCR-RFLP分析
【机构】 福建省农科院生物技术中心;
【摘要】 <正> 本研究选取念珠藻目中2个属,鱼腥藻属(Anabaena)和念珠藻属(Nostoc)中的22种自生与共生的固氮蓝细菌以及聚球藻805(Synechococcus)为样本,对其进行了16S-23S rRNA间隔区(ITS)的PCR-RFLP分析,以期获得其间的系统进化关系。用引物322-340对23种蓝细菌进行扩增,结果发现在300bp~900bp间不同的蓝细菌可扩增出2~3条带。为了进一步区别不同的蓝细菌,用引物320-340对蓝藻1637~1976位置进行扩增,发现在这区间各扩增出大小不同的一条带型,这表明了23种蓝藻在此区间可能有片段的缺失。对扩增片段进行6种限制性内切酶酶切,酶切结果用UPMGA聚类分析后发现,对ITS扩增结果的酶切分析所形成的类群组的情况较为复杂。除805外,其它的蓝藻可分为两大类,由Anabaena与Nostoc样品形成的类群组之间互相交叉。而形态学上被归为念珠藻的8981却被聚力鱼腥藻的类群中。通过本实验,也可得出结论:16S-23S rRNA转录单元内间隔区ITS-RFLP可作为区别蓝细菌属内种间关系的一种方法,但不适于区别属之间或属以上水平的蓝细菌。
- 【会议录名称】 华东六省一市生物化学与分子生物学会2003年学术交流会论文摘要集
- 【会议名称】华东六省一市生物化学与分子生物学会2003年学术交流会
- 【会议时间】2003-08
- 【会议地点】中国上海
- 【分类号】Q93
- 【主办单位】上海市生物化学与分子生物学会、江苏省生物化学与分子生物学会、浙江省生物化学与分子生物学会、安徽省生物化学与分子生物学会、福建省生物化学与分子生物学会、江西省生物化学与分子生物学会、山东省生物化学与分子生物学会