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CSFV猪瘟病毒NS3非结构蛋白结构模型的建立
【作者】 徐卓菲； 司有辉； 何雁南； 晁彦杰； 钱平； 陈焕春；
【机构】 华中农业大学动物医学院动物病毒室；
【摘要】 黄病毒科家族分为三个病毒属:黄病毒属、丙型肝炎病毒属和瘟病毒属,其中前两个病毒属里包括了一些主要的人类病原体,后一个属为动物的病原体。该科的 NS3蛋白是一个非常重要的多功能非结构蛋白,具有三种酶的活性,前三分之一区域 NH2-端具有丝氨酸蛋白酶活性,后三分之二区域COOH-端具有RNA螺旋酶和NTPs水解酶活性,现已证明NS3蛋白的活性在病毒的复制、翻译以及病毒与宿主细胞的互作中发挥重要的作用,因此是一个可以作为抗病毒药物研究的良好的靶基因。黄病毒科病毒的复制循环需要全长NS3蛋白所有活性的协调控制。在本研究中,我们分析了已有深入研究的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)的NS3蛋白,利用蛋白质建模软件MODELLER和分子动力学方法对猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV) 的全长NS3蛋白进行了结构建模,并通过GROMS96、ProCheck和PyMOL等多种程序完成了对该蛋白质的优化和评价。猪瘟病毒全长NS3蛋白质模型的建立为研究猪瘟病毒的复制模式以及蛋白酶和螺旋酶的功能提供了一个良好的工具。
- 【会议录名称】 2006年度学术研讨会论文摘要汇编
- 【会议名称】2006年度学术研讨会
- 【会议时间】2006-10
- 【会议地点】中国湖北武汉
- 【分类号】S852.65
- 【主办单位】湖北省生物工程学会