大豆叶绿体基因组单核苷酸多样性

【作者】 田晓俊； 阎新； 邹洪锋； 杨桂玲； 郭凌； 饶琼； 余潮； 朱友林；

【机构】 南昌大学生命科学学院基因工程与分子生物学实验室；

【摘要】 本文对中国358份野生和栽培大豆材料的10个cpDNA基因位点共5 743bp的cpDNA序列进行了分析,共发现了24个SNPs位点,其中23个SNPs为颠换,仅1个为转换。野生大豆和栽培大豆群体cpDNA的遗传多样性θ值分别为0．79×10-3,0．14×10-3,栽培大豆群体cpDNA的θ值仅保留了野生大豆群体17．8％的核苷酸多样性。通过对大豆cpDNA单倍型多样性及其地理分布等进行统计分析,得出结论:中国野生大豆cpDNA单倍型多样性最大的三个区域为长江、黄淮和西南地区,H值分别为0．737、0．736和0．722;中国栽培大豆cpDNA单倍型多样性最大的三个区域为西南、黄淮和长江地区,H值分别为0．714、0．642和0．616。因而认为中国野生大豆cpDNA 单倍型多样性中心为黄淮、中南和西南地区:中国栽培大豆cpDNA单倍型多样性中心为西南、黄淮和长江地区。并发现个别单倍型在地理分布上显示出了一定的渐变趋势,从而支持多中心起源学说。更多还原