野生和栽培大豆核苷酸序列多样性

【作者】 阎新； 杨桂玲； 邹洪锋； 饶琼； 郭凌； 余潮； 朱友林；

【机构】 南昌大学生命科学学院基因工程与分子生物学实验室；

【摘要】 本文选择87份有广泛地理代表性的野生大豆和栽培大豆为材料,以33个大豆功能基因的35个DNA片段为研究对象,在核苷酸序列水平上研究野生大豆和栽培大豆的群体遗传结构及其在栽培驯化过程中的演变规律。结果表明野生大豆的SNPs频率为2．22×10-3(θ)和 1．91×10-3(p),栽培大豆的SNPs频率为1．18×10-3(θ)和1．43×10-3(p),即栽培大豆的核苷酸多样性比野生大豆减少了46．8％(θ)和25．1％(p)。栽培大豆编码区SNPs频率比野生大豆减少了36．5％(θ)和40．7％(p),非编码区SNPs频率比野生大豆减少了50．7％(θ)和18．6％ (p),即非编码区中的SNPs的频率从野生大豆到栽培大豆减少得更多。单就编码区而言,引起同义变异的SNPs的频率从野生大豆到栽培大豆减少得更多。由野生大豆向栽培大豆驯化的过程中减少了大量SNPs,其中减少的主要是稀有SNPs,也有部分普通SNPs。在野生大豆和栽培大豆中分别发现四个和两个位点受到了选择。本文为进一步揭示大豆起源、进化的分子过程与分子机理提供了必要的研究基础。更多还原