新基因NYGGF4在肥胖者脂肪组织中的表达验证及生物信息学分析

【作者】 陈小惠； 郭锡熔； 李晓南； 王玢； 倪毓辉； 张敏； 吴伟玲； 陈荣华；

【机构】 南京医科大学附属南京妇幼保健院儿科； 南京医科大学儿科医学研究所；

【摘要】 目的验证新基因 NYGGF4在肥胖者脂肪组织中的表达,初步探讨 NYGGF4的生物信息学特征。方法采用 RT-PCR 技术验证肥胖与正常人脂肪组织中 NYGGF4基因的表达差异,应用生物信息学方法初步分析 NYGGF4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等。结果 NYGGF4基因差异高表达于肥胖者脂肪组织中,该基因 cDNA 全长1527bp,开放阅读框长753bp,编码250个氨基酸,预测分子量28.271kDa,定位在胞浆,蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,为一非分泌蛋白,蛋白结构域分析提示 NYGGF4的 C 端有一 PTB(phosphocyrosine- binding domain)结构域,提示可能参与信号转导。结论 NYGGF4基因差异表达于肥胖者脂肪组织中,可能是胞浆内一个信号转导分子。更多还原