【作者】 杨文强； 邓明华； 钱敏平；

【Author】 YANG Wenqiang DENG Minghua QIAN Minping School of Mathematical Sciences, Peking University

【机构】 北京大学数学学院；

【摘要】 识别编码基因序列是生物信息学中的一个公开问题。基因识别的关键是预测出基因结构中外显子(exon)与内含(intron)之间的剪切位点(splicing site)。本文引入统计学中的隐马尔可夫过程,对剪切位点中的供点(donor site)区域建立相应的模型,通过自学习之后,得到隐马尔可夫模型的重估参数,用以识别DNA序列中的剪切位点。更多还原

【Abstract】 Identifying the gene from DNA sequence is an open problem in Bioinformatics. The key of the gene identification is to predict the splicing sites between exon and intron. This work describes a hidden Markov model(HMM) corresponding to the donor site domain. We predict the donor sites from gene sequence by the revalued HMM through learning on the training data set.更多还原