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用于人粪便菌群分析的PCR-DGGE条件优化
【机构】 甘肃中医学院；
【摘要】 目的通过对人粪便菌群PCR-DGGE图谱条件优化,为如实地反映肠道细菌多样性奠定基础。方法以细菌16S rDNA V3和V6-V8区为靶序列进行PCR扩增,应用DGGE方法对人粪便变性剂梯度范围、电泳时长、染色时间及靶序列进行优化。结果粪便V3区的DGGE图谱分离效果较V6-V8区好;V3区最佳变性剂梯度范围分别为40%～65%,最佳电泳时间约为12 h;凝胶的最佳染色时间为15 min。结论本研究成功地优化了应用于粪便细菌多样性分析的PCR-DGGE方法,为下一步应用该法分析不同民族人的粪便菌群多样性建立了实验参数。
- 【会议录名称】 2012全国临床微生物与感染免疫学术研讨会论文集
- 【会议名称】2012全国临床微生物与感染免疫学术研讨会
- 【会议时间】2012-10-13
- 【会议地点】中国重庆
- 【分类号】R440
- 【主办单位】中华医学会、中华医学会微生物学与免疫学分会