麻风病的全基因组关联研究

【作者】 张福仁； 黄薇； 陈树民； 孙良丹； 刘红； 李毅； 崔勇； 颜潇潇； 杨海涛； 杨荣德； 初同胜； 张弛； 张林； 韩建文； 于功奇； 权晟； 于永翔； 张铮； 史本青； 张连华； 程晖； 王昌媛； 林燕； 郑厚峰； 付希安； 左先波； 王强； 龙恒； 孙一萍； 程义林； 田洪青； 周伏圣； 刘华绪； 陆闻生； 何素敏； 杜文丽； 沈珉； 金祺祎； 王颖； Hui-Qi Low； Tantoso Erwin； 李金勇； 赵欣； 娇曰林； 毛立国； 殷刚； 姜珍霞； 王晓东； 于京平； 胡宗厚； 巩翠华； 柳玉强； 刘瑞玉； 王德民； 魏东； 刘金献； 曹巍鲲； 曹恒仲； 李永平； 阎维国； 魏世玉； 王奎军； Martin L Hibberd； 杨森； 张学军； 刘建军；

【机构】 山东省皮肤病性病防治研究所； 上海国家人类基因组健康与疾病基因组学重点实验室； 安徽医科大学第一附属医院皮肤科； 教育部和安徽省重大疾病基因资源利用重点实验室/安徽医科大学皮肤性病学教研室； 新加坡基因组研究所； 江苏省疾病预防控制中心； 云南省文山州皮肤病防治所； 安徽省皮肤病防治所； 潍坊市皮肤病防治所； 临沂市皮肤病防治所； 烟台市皮肤病防治所； 济宁市皮肤病防治所； 枣庄市皮肤病防治院； 青岛市疾病预防控制中心； 济南市皮肤病防治院； 威海市疾病预防控制中心； 日照市皮肤病防治所； 淄博市疾病预防控制中心； 栖霞市皮肤病防治所； 临朐县皮肤病防治站； 诸城市皮肤病防治站； 邹城市皮肤病防治站； 临沭县皮肤病防治站； 费县第二人民医院； 泗水县皮肤病防治站； 滕州市皮肤病防治站； 寿光市皮肤病防治站； 莱西市皮肤病防治站； 平度市皮肤病防治站；

【摘要】 背景:麻风分枝杆菌宿主的局限和难以在体外培养,限制了对麻风的研究及其生物学方面的了解。宿主的遗传因素不仅影响对麻风菌的易感性,也影响麻风病的病程。方法 :本研究采用Illumina Human 610-Quad BeadChips对706个麻风病例及1225个正常对照进行全基因组扫描,扫描的结果采用PLINK软件进行统计学分析。根据分析结果对可能阳性的93个SNPs位点在3254个麻风病例及5955个正常对照中验证,以确定麻风病的易感基因。同时我们在麻风的不同临床型别中进行了异质性检验,以期发现与型别相关的易感基因。结果:（1）研究发现位于6个区域的15个SNPs达到了全基因关联研究水平(P值<1.0×10^-8),定位了6个麻风病的易感基因:HLA-DR,RIPK2,TNFSF15,CCDC122,C13ORF31,NOD2。另外LRRK2基因对应SNP的P值为5.10×10^-5,提示该基因可能为麻风病的易感基因。（2）研究发现5个SNPs在多菌型麻风病中的遗传效力强于少菌型。结论:位于调节固有免疫NOD2介导的信号通路中基因的变异与麻风病的易感性相关。更多还原