三株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析

【作者】 谢芝勋； 唐小飞； 董键宝； 刘加波； 庞耀珊； 邓显文； 谢志勤；

【机构】 广西兽医研究所；

【摘要】 根据GenBank公布的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的全基因序列,设计了8对引物,运用RT-PCR方法获取了三株H9N2亚型AⅣ广西地方分离株A/Chicken/Guangxi/31/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00的全基因序列,并对所得序列进行了比较分析。同源性分析及遗传进化分析发现,所分离的三个毒株与A/chicken/Guangxi/9/99、A/chicken/Guangxi/10/99和A/Chicken/Guangdong/4/00的相应基因的核苷酸序列有着较高的同源性和较近的亲缘关系,可能起源于同一种系。所分离毒株中每个毒株的8个基因,在遗传进化树上的分支不具有统一性,说明此三个毒株为不同基因亚系间发生自然重排的产物。氨基酸序列比较发现,A/Chicken/Guangxi/31/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00三株AIV的NA基因核苷酸序列在开发性阅读框架的187～188位缺失了ACAGAGATA共9个核苷酸。三个分离株的HA蛋白第226位氨基酸为Gln,证明它们为非人类易感性H9N2亚型AIV。更多还原