广州地区泌尿生殖道沙眼衣原体基因分型研究

【作者】 杨斌； 郑和平； 薛耀华； 吴兴中； 江汉宁； 黄进梅；

【机构】 广东省皮肤性病防治中心；

【摘要】 目的:研究2008年广州地区泌尿生殖道感染沙眼衣原体基因型分布和VS1-VS2基因突变性。方法:巢氏PCR扩增Omp1基因的VS1-VS2序列,ABI prism 377自动测序仪测序,运用DNAstar软件进行临床菌株与标准菌株序列的比对。结果:95例临床标本株扩增出约453bp大小的VS1-VS2序列。与标准株比对,除2例测序出现双峰无法确定基因型(可能为昆合型感染)外,93株菌株分成7个血清型,包括D型1 2株(12.9%)、E型28株(30.1%)、F型17株(18.3%)、G型6株(6.4%)、H型4株(4.3%)、J型16株(17.2%)、K型10株(10.6%);序列分析发现9株存在碱基的突变或插入,且多为有意义突变,突变率为9.7%,见于K、E、G和D型。结论:直接Omp1基因VS1-VS2测序可进行沙眼衣原体基因分型和型内变异性分析,广州地区以E、F、J和D型优势流行,K型显著增多;型内突变性与其它地区间存在差异。更多还原