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基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上分布及探针长度优化方法
【机构】 植物资源保护与可持续利用重点实验室中国科学院华南植物园； 中国科学院研究生院； 云南瑞升烟草技术(集团)有限公司；
【摘要】 采用基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)方法研究牛筋草AA基因组在穇子染色体上分布,探讨AA、BB基因组的同源关系。选用超声波破碎仪方法预剪切,缺口平移法标记牛筋草Eleusine indica(L.)Gaertn.总DNA为探针,BB基因组E.floccifolia(Forssk.)Spreng.总DNA为封阻,同AABB基因组穇子E coracana(L.)Gaertn.的中期染色体杂交。结果表明,牛筋草AA基因组分布在穇子18条染色体上。不加封阻或加过量封阻的对照实验不能鉴别AA基因组,说明AA和BB基因组间的分化程度不大,双方共享的重复序列较多。牛筋草与E.floccifolia总DNA分别在超声波破碎仪2分钟和3分钟处理后,得到峰值为300-750bp的DNA片段,剪切时间的差异说明不同物种的超声波破碎仪方法需要调整,以获得合适长度的探针。
【基金】 国家自然科学基金项目(30700043);中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室资助项目(200922);教育部留学回国人员科研启动基金资助项目(2011-1139);中国科学院生命科学领域基础前沿研究专项(KSCX2-EW-J-28)资助
- 【会议录名称】 2011年全国系统与进化植物学暨第十届青年学术研讨会论文集
- 【会议名称】后植物志时代的系统与进化植物学——2011年全国系统与进化植物学暨第十届青年学术研讨会
- 【会议时间】2011-10-26
- 【会议地点】中国云南昆明
- 【分类号】Q943.2
- 【主办单位】中国植物学会系统与进化植物学专业委员会、云南省植物学会