黄孢原毛平革菌转录组分析

【作者】 赵传武； 王中山； 张义正； 李校；

【机构】 四川省分子生物学及生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院；

【摘要】 <正>黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)能降解植物细胞壁组分,如纤维素,半维素以及比较稳定的木质素,它成为了研究与木质素降解相关的生理和遗传的模式物种,也是目前被研究的最多的白腐真菌。黄孢原毛平革菌的基因组大小为35.1 Mbp,共预测出10,048个基因(2006年第2版)。本研究使用二代测序技术(Solexa HiSeq 2000)对黄孢原毛平革菌的多种生长条件和各个生长时期的混合转录组进行测序,以了解其基因表达情况并挖掘其功能基因。高通量测序共获得20,300,549条长度为90 bp的双端clean reads,更多还原