Aegilops variabilis No.1抗禾谷孢囊线虫的RNA-Seq分析

【作者】 徐德林； 龙海； 李嘉； 张洁； 李林； 陈欣； 李景良； 高丽鹃； 潘志芬； 邓光兵； 余懋群；

【机构】 中国科学院成都生物研究所； 中国科学院研究生院；

【摘要】 禾谷孢囊线虫(cereal cyst nematode,CCN,Heterodera avanae)是导致谷类作物减产的最重要虫害。为了全面深入了解植物对该线虫的抗性,本文以抗禾谷孢囊线虫(cerealcyst nematode,CCN,Heterodera avanae)的Aegilops variabilis No.1(易变山羊草)为材料,采用第二代测序技术(next generation sequencing)RNA-Seq,对接种CCN后30小时、3天、9天和同期未接种线虫的根部总RNA进行测序,共获得了7100万条长为50bp的序列。分析发现,接虫线虫和不接虫线虫的两个处理间,三个时期分别有3459、322和413条差异表达的转录本(difference expression transcripts,DETs),并同时鉴定出多个在特定时间点出现表达差异的DET。进一步分析发现,分别有18、7和3个调控途径(pathway)在线虫抗性中起着关键作用。本研究还发现有18个DET和苯丙氨酸代谢持续在两种处理的不同时间点中表现显著差异,说明它们很可能是该材料CCN抗性发生的重要组成部分。本研究首次报道了线虫侵染后的易变山羊草的表达谱分析(expression profiling),鉴定出一系列与CCN抗性相关的候选基因和调控途径,为全面阐释植物的抗CCN机制具有重要意义。更多还原