H5N2亚型禽流感病毒的基因特征及遗传进化分析

【作者】 段振华； 张翼； 施建忠； 刘丽玲； 田国彬； 曾显营； 张书霞； 陆承平； 华育平； 陈化兰； 李雁冰；

【机构】 南京农业大学动物医学院； 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点开放实验室/国家禽流感参考实验室； 东北林业大学野生动物资源学院；

【摘要】 为了解我国野生水禽携带的H5N2亚型禽流感病毒(AIV)的特征。本研究对2005-2006年江西省和黑龙江省正常野鸭体内分离到的11株H5N2亚型AIV进行全基因测定和遗传演化分析。结果表明:2005年分离自江西省的10株H5N2亚型禽流感病毒的HA基因裂解位点均具有4～6个连续的碱性氨基酸,同属于高致病力毒株;2006年分离自黑龙江省的1株H5N2亚型禽流感病毒的HA基因裂解位点为R-E-T-R,属于典型的H5亚型低致病力毒株。遗传进化上,11株病毒同属于欧亚种系,HA、NA、PB1、PA和NS基因进化关系较近,但分别以不同的毒株为祖先进化而来;PB2、NP和M基因在各自的进化关系上距离较远,核苷酸同源率差异较大。并且11株病毒是以多基因型形式存在。更多还原