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猪FBXL8基因第二内含子的克隆测序及SNP检测
【作者】 李勇； 杨述林； 崔文涛； 牟玉连； 唐中林； 储明星； 彭克美； 李奎；
【机构】 江西农业大学动物科技学院； 华中农业大学动物科学-动物医学院； 中国农业科学院畜牧研究所；
【摘要】 以人FBXL8基因的mRNA序列作为信息探针,搜集猪同源基因EST序列,并构建EST重叠群Contig,设计出合适的引物,以湖北通城、大白和长白猪基因组为模板,应用PCR技术克隆测定FBXL8基因的第二内含子序列。序列分析结果表明,猪FBXL8基因第二内含子为855bp。通过运用SEQMAN软件对三个品种的序列比较分析,初步发现在第二内含子的第325、361和493位碱基为SNP位点。这为进一步研究猪FBXL8基因的分子生物学特性和功能奠定了一定基础。
【Abstract】 The Homo FBXL8 mRNA sequence was used as an information probe to search the porcine homologous ESTs sequence,and construct the ESTs contig.Then we design the primers according it. Tongchen,Landrace and large white breeds DNA were used as genomic template to amplify the second intron of porcine FBXL8 gene by PCR.The sequence analysis result indicates that it is a sequence of 855 bp long.Moreover,SEQMAN software was conducted to compare and analyze these sequences,and it was found that there are three SNPs in the 325th,361st and 493rd respectively.This result establishes some basis for further study on the molecular bio-information characteristic and function of porcine FBXL8 gene.
【Key words】 FBXL8； intron 2； cloning and sequencing； SNP detection；
- 【会议录名称】 中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十六次学术研讨会论文集
- 【会议名称】中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第五次会员代表大会暨第十六次学术研讨会
- 【会议时间】2010-08-10
- 【会议地点】中国青海西宁
- 【分类号】Q78
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会动物解剖学与组织胚胎学分会