三株新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

【作者】 袁萍； 闫丽辉； 成进； 汪萍； 柏庆； 李延涛；

【机构】 新疆天康畜牧生物技术股份有限公司； 哈尔滨兽医研究所哈尔滨维科生物技术开发公司； 新疆畜牧科学院兽医研究所；

【摘要】 本试验利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中.经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行了分析和比较.序列分析结果表明,所获得的3株分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%.三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明:QH3株NDV为基因Ⅷ型;A4株NDV为基因Ⅵ型;HLJ株NDV为基因Ⅸ型.更多还原