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不同禽源副粘病毒分离株F基因的克隆与序列分析
【作者】 王旋; 黄兵; 张训海; 于可响; 钟登科; 宋敏训; 龚争; 赵磊;
【机构】 家禽疫病防控监测安徽省重点实验室; 山东省农业科学院家禽研究所;
【摘要】 分别对鸡源、鸭源、鹅源NDV强毒分离株(WF00C、WF00D、WF00G)的F基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定,对其核苷酸和推导氨基酸序列的分析结果表明,各分离株F基因均含1个完整的开放阅读框(ORF),全长为1662bp,编码553个氨基酸,有6个潜在的糖基化位点,裂解位点区的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与强毒株特征相符,具有第101位的K(赖氨酸)和121位的V(缬氨酸),符合基因Ⅶ型NDV特征;WF00C株有13个半胱氨酸(Cys)残基,WF00D株和WF00G株各有12个Cys残基;在限制性内切酶(RE)位点(nt334-1682)的分布上,三个毒株均存在多数鹅源分离株特有的973nt和1249nt RsaⅠ位点;WF00D株与WF00C株、WF00G株以及GenBank下载的15株各基因型代表株的F基因编码区同源性进行比较,其核苷酸序列同源率为84.7~99.3%,推导的氨基酸序列同源率为88.4~98.9%;三个分离株间的同源性较高,其与ZJ1、SF02和NA1等鹅源毒株之间差异较小,而与Lasota、F48E9等毒株之间差异明显。根据NDV系统发育进化树、酶切位点分析以及基因分型结果,证明它们的基因型均为Ⅶd亚型。
- 【会议录名称】 中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集(下册)
- 【会议名称】中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会
- 【会议时间】2009-09-01
- 【会议地点】中国广西南宁
- 【分类号】S852.65
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会动物传染病学分会(Branch of Animal Infectious Diseases,CAAV)