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猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1蛋白二级结构及B细胞抗原表位预测
【作者】 赵武； 李斌； 梁家幸； 梁保忠； 姚瑞英； 黄安国； 何颖； 蒋玉雯；
【机构】 广西兽医研究所病毒室；
【摘要】 以PPV-N株的VP1蛋白基因序列为材料,采用Chou-Fasman方法、Garnier-Robson方法和Karplus-Schultz方法来预测VP1蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法预测VP1蛋白的亲水性,用Emini法预测VP1蛋白的表面可能性,用Jameson-Wolf方法预测VP1蛋白的抗原指数,然后综合分析VP1蛋白的B细胞抗原表位.结果表明,PPV-N株VP1蛋白的二级结构以β-折叠为主,并有较多的转角和无规则卷曲区域,在序列的20-56,61-80,86-130,136-188区域最有可能是B细胞抗原表位的优势区域.本研究将为PPV-N株自然弱毒的分子机理以及反向疫苗学的研究提供一定的理论依据.
【基金】 广西自然科学基金项目(桂科自0728102)
- 【会议录名称】 中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）
- 【会议名称】中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会
- 【会议时间】2009-09-01
- 【会议地点】中国广西南宁
- 【分类号】S852.65
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会动物传染病学分会(Branch of Animal Infectious Diseases,CAAV)