云贵地区淡水湖中类蛭弧菌的多样性分析

【作者】 刘涛华； 曾佳； 金方； 陈玉如； 牟丽丽； 吕倩； 王颜颜； 康颖倩；

【机构】 贵阳医学院微生物教研室； 贵阳医学院生化教研室；

【摘要】 目的对云贵地区阿哈湖、百花湖及云南滇池不同深度的湖水中分离的类蛭弧菌进行分类鉴定,深入了解云贵地区淡水中类蛭弧菌多样性,发掘研究云贵地区的淡水类蛭弧菌资源。方法①利用筛选出的2株宿主菌株分离培养类蛭弧菌;②对分离出的类蛭弧菌进行了16S rRNA基因测序分析,将所获得的序列与GenBank数据库进行BLAST比对;③以NJ法(MEGA 6.0软件)构建了三个湖泊中类蛭弧菌16S rRNA序列的系统发育树,并以ML法(PHYLIP3.1软件)加以验证。结果①本研究的文库容量C值为75%,说明覆盖率较高,基本可以反应三个湖泊中类蛭弧菌的多样性情况;②12条类蛭弧菌16S rRNA中的7条(58%)与GenBank中已培养细菌的同源性最高(95%-99%),其余5条与已有的未培养细菌同源性较高(88%-99%):③在发育树中,本研究所得的类蛭弧菌分属3个簇群,γ-Proteobacteria(8.3%),δ-Proteobacteria(50.0%),Sphingobacteria(41.7%)。在百花湖中分离的一株B0-6类蛭弧菌与肠杆菌科(Enterobacteriaceae)肠杆菌属(Enterobacter)的路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)LHR-02同源性较高(99.93%)。其他6株(主要集中于贵州阿哈湖)与噬菌弧菌科(Bacteriovoracaceae)噬菌弧菌属(Bacteriovorax)的Bacteriovorax sp.EPA同源性较高。讨论①路德维希肠杆菌为益生菌,对水产病原菌具有较强的抑制效果。本研究中分离的相应新型菌株可为今后水产养殖类病害的防控、污水处理及新型抗菌物质的开发等提供新的菌株资源;②其余5株菌株的序列blast比对结果均显示为不可培养细菌序列,主要集中于云南演池,推测在云南滇池区域存在着尚未开发的新型微生物资源,将在下一步研究中进行实验验证。更多还原