蛹虫草SSU rDNA中Ⅰ型内含子分析

【作者】 廉添添； 杨涛； 孙军德； 董彩虹；

【机构】 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室； 沈阳农业大学土地与环境学院；

【摘要】 蛹虫草[Cordyceps militaris(L.)Link】为虫草属(Cordyceps)模式种,是少数可以规模化生产的虫草属真菌之一。目前市场上子实体商品性状差别较大,其种内多样性有待研究。真菌中Ⅰ型内含子已被广泛用于菌种鉴定和多样性分析,本研究利用PCR和:RT-PCR对蛹虫草SSU rDNA中Ⅰ型内含子的种类、分布频率及变异性进行分析,从而对蛹虫草的种内多样性进行研究,为其栽培及优质菌种的选育提供理论基础。选取具有不同栽培性状的蛹虫草菌株,对其SSU rDNA中Ⅰ型内含子进行分析,结果显示蛹虫草SSU rDNA中有两个Ⅰ型内含子的插入位点,根据插入位点将其分别命名为Cmi.S943和Cmi.S1199,内含子二级结构特征显示Cmi.S943属于IC1而Cmi-S1199内含子属于IE3。不同蛹虫草菌株SSU rDNA中Ⅰ型内含子变异性分析显示P、Q、R、S四个保守的核酸序列元件没有发生核酸变异,而且维持Ⅰ型内含子二级结构的配对区大部分没有发生核酸变异。两个插入位点的内含子之间没有显著性的相似度。对实验室保存的菌株和GenBank获取的蛹虫草SSU rDNA序列进行分析,可以将蛹虫草基因型分为3类,其中Ⅰ型菌株不含有内含子、Ⅱ型菌株只含有Cmi.S943内含子、Ⅲ型蛹虫草同时包含Cmi.S943和Cmi.1199两个内含子。栽培试验显示Ⅱ型菌株栽培种可以产子囊壳,Ⅲ型菌株不能产生子囊壳。Ⅱ型菌株与Ⅲ型菌株杂交过程中出现Cmi.S1199内含子的丢失。更多还原