节点文献

腐霉属DNA条形码初步探究

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 龙艳艳韦继光郭良栋邓晖

【机构】 广西大学农学院中国科学院微生物研究所中国农业科学院植物保护研究所

【摘要】 腐霉是世界性分布的一类菌物,有的种是植物的重要病原菌,物种的正确鉴定是腐霉流行病预报和防治的基础。作者以39种(74个菌株)为材料,结合GenBank的数据库,分析ITS、COXI、COXII、β-tubulin四个基因片段的腐霉属的种内和种间变异率,筛选适合腐霉物种鉴定的DNA条形码。研究结果表明:在分子系统发育分析中,ITS、β-tubulin和COXI三个片段序列都可将腐霉属划分为3个类群,而且与腐霉孢子囊形态(球形、丝状及介于两者之间的球形与丝状复合体)一致。但COXII建立的分子系统树结构与腐霉孢子囊的形态缺乏对应关系。ITS的种内相似率为90.6%-100%,COXII的种内相似率为96.6%-100%,β-tubulin的种内相似率为94.6%-100%,COXI的种内相似率为95.2%-100%;ITS、COXII、β-tubulin和COXI的种间相似率分别为:90.7%-100%、96.9%-99.9%、97.6%-100%和95.4%-99.8%。COXI的物种分辨率为100%,COXII和β-tubulin为97.2%,ITS为92.3%。因此COXI是腐霉属理想的DNA条形码。

【关键词】 腐霉系统进化关系DNA条形码
  • 【会议录名称】 2010年中国菌物学会学术年会论文摘要集
  • 【会议名称】2010年中国菌物学会学术年会
  • 【会议时间】2010-08-14
  • 【会议地点】中国湖南张家界
  • 【分类号】Q939
  • 【主办单位】中国菌物学会(Mycological Society of China)
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络