利用miRNA芯片研究胃癌发病相关的miRNA及下游信号通路分析

【作者】 刘奔； 王涛； 郑红； 李海欣； 张丽娜； 陈可欣； 杨达； 张微；

【机构】 乳腺癌防治教育部重点实验室天津市肿瘤防治重点实验室天津医科大学附属肿瘤医院流行病室； 美国M.D.Anderson癌症中心病理系、癌症基因组学中心实验室；

【摘要】 目的检测人胃癌与对照的癌旁组织miRNA表达谱的差异,筛选差异表达miRNA,对筛选出的高表达miRNA的下游靶信号通路进行分析,为胃癌防止中的miRNA干预策略提供可供选择的靶点miRNA。方法利用含15644个成熟miRNA基因的affymetrix人全基因组miRNA2.0芯片,检测92例胃癌和10例癌旁正常组织的差异miRNA表达基因。筛选出上调表达和下调表达的miRNA,并对胃癌不同临床分期和发生部位等临床分组中miRNA表达差异进了统计学分析。对差异miRNA作用的靶基因进行了信号通路分析。结果差异表达的miRNA基因数为608个,其中2倍以上上调的23个,下调的有5个。差异表达miRNA基因分属8个不同的miRNA簇。其中5簇miRNA为首次在胃癌中发现有表达差异。统计学分析表明其中8种miRNA表达在胃癌分期,性别,年龄,发生部位等不同临床分组均有统计学差异。生物信息学预测的靶基因分属Akt,Wnt,p53等不同信号通路。结论基因芯片筛选出的胃癌mi A差异表达基因大部分为首次发现并报道,筛选的A可以作为预测RN miRN胃癌发病指标和治疗的潜在靶点。更多还原