【作者】 沈玉梅； 汤道年； 江敏； 李小卫； 伍新燕； 龚兵； 赵小东； 邵志峰；

【Author】 Yu-Mei Shen;Daonian Tang;Min Jiang;Xiaowei Li;Xin-Yan Wu;Bing Gong;Xiaodong Zhao;Zhifeng Shao;Shanghai Center for Systems Biomedicine, Key Laboratory of Systems Biomedicine and Bio-ID Center, Shanghai Jiao Tong University;Key Laboratory for Advanced Materials and Institute of Fine Chemicals, East China University of Science and Technology;School of Biomedical Engineering, Bio-ID Center, Shanghai Jiao Tong University;Department of Chemistry, University at Buffalo, State University of New York;College of Chemistry, Beijing Normal University;

【机构】 上海交通大学系统生物医学研究院,系统生物医学教育部重点实验室； 华东理工大学化学与分子工程学院精细化工研究所； 上海交通大学生物医学工程学院,Bio-ID 研究中心； 华东理工大学化学与分子工程学院,精细化工研究所； 布法罗纽约州立大学化学系； 北京师范大学化学学院；

【摘要】 分别以5-碘-2’-脱氧尿苷、5-碘-2’-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2’-脱氧腺苷以及7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记四个不同碱基的脱氧核糖核苷酸,并研究了该类荧光标记核苷酸作为可逆终端在DNA合成测序中的应用。其产物结构经过1H NMR,HRMS,31P NMR表征;并且对合成的四个荧光标记核苷酸进行了DNA高通量测序,结果表明该类荧光标记核苷酸作为DNA合成测序的可逆终端能够满足高通量测序的生化反应要求,具备较好的实用前景。更多还原

【Abstract】 Starting from 5-iodo-2’-deoxyuridine, 5-iodo-2’-deoxycyridine, 7-deazo-7-iodo- 2’-deoxyadenosine and 7-deazo-7-iodo-2’-deoxyguanosine, four kinds of fluorescence labelled necleotides with four different bases through disulfide were synthesized and characterized. The synthesized fluorescence labeled nucleotides can be recognized and accepted by an identified DNA polymerase, incorporated faithfully into DNA strand, followed by cleaved completely by DTT within 1 min. These results demonstrate that the fluorescence labeled nucleotides have potential value as reversible terminators in DNA sequencing by synthesis.更多还原