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关于HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂药物的三维定量构效关系和分子对接研究
【作者】 李丽娜; 苏莉; 张晓昀; 黄晓燕; 单志杰; 翟红林;
【机构】 甘肃省兰州市兰州大学化学化工学院;
【摘要】 对于一系列具有抗艾滋活性的非核苷类逆转录酶抑制剂进行了三维定量构效关系和对接研究。三维定量构效关系研究用到的方法是比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)。其交互验证相关系数分别为0.583和0.521,非交互验证相关系数为0.975和0.953,得到的模型最终对于测试集的交互验证相关系数为0.771和0.601。为了更加进一步的了解药物的三维结构要求,又利用autodock4.2进行了分子对接研究。对比三维定量构效关系和分子对接的结果可以发现,对于药物三维结构的要求,两种方法揭示的接结果是一致的。在三维定量构效关系的基础上,我们设计了一系列新的化合物,并将化合物带入所建立的模型中发现,设计的化合物相较于原来化合物具有更高的活性。
【关键词】 3D-QSAR;
CoMFA;
CoMSIA;
分子对接;
非核苷类逆转录酶抑制剂;
- 【会议录名称】 第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集
- 【会议名称】第十一届全国计算(机)化学学术会议
- 【会议时间】2011-08-05
- 【会议地点】中国甘肃兰州
- 【分类号】TQ460.1
- 【主办单位】中国化学会