牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺转录组分析

【作者】 范兆飞； 尤锋； 王丽娟； 翁申达； 吴志昊； 胡金伟； 邹玉霞； 谭训刚； 张培军；

【机构】 中国科学院海洋研究所； 中国科学院大学；

【摘要】 牙鲆是我国重要的海水养殖经济鱼类,其雌性个体明显大于雄性个体,外界环境因子与遗传因子共同决定影响其性别,目前关于其性别决定及分化机制仍不清楚,更多的性别相关基因挖掘和性别相关的信号通路构建将为牙鲆性别决定机制的揭示奠定基础。本研究对牙鲆Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期卵巢和卵子,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期精巢和精子、精液雌雄分别进行混样建库,采用Illumina Solexa平台进行测序,雌雄性腺文库测序分别获得22,478,374和20,161,959个reads,共同拼接得到97,233个contigs,其中21,697个contigs得到注释,并进行GO分析和KEGG通路图的构建,其中参与信号转导,细胞生长与凋亡,内分泌的基因较多,根据RPKM值和显著性分析(DEGseq,an R package),筛选得到2193个雌性高表达基因和887个雄性高表达基因,其中有21个雌性高表达和13个雄性高表达性别相关基因,包括cyp19a,dmrt1,foxl2等研究报道较多的性别相关基因和在鱼类中鲜有报道的h2a.x,zar1,fem1c,wee2,sox8a,sox6b等基因,此外还在KEGG分析中构建出性激素合成,雌激素作用信号,Wnt信号通路等性别相关的代谢合成以及信号转导通路。在性腺中集中表达的基因大多与性腺发育,配子发生,性激素合成紧密相关,并由这些基因参与组成一系列的代谢合成以及信号转导通路完成对这些发育事件的调控,本研究为进一步解析牙鲆及其它鱼类性别分化机制提供了基础数据资源。更多还原