节点文献
三种遗传标记用于区分不同地理株骨条藻的比较分析
【作者】 陈国福； 张春云； 闫培生； 徐仲； 王广策； 张宝玉；
【机构】 哈尔滨工业大学(威海)； 中国科学院海洋研究所；
【摘要】 近年来,越来越多的研究表明,骨条藻(Skeletonema Greville)是一类具有广泛地理分布的浮游硅藻,骨条藻的不同地理种群具有不同的遗传特征。本文比较研究了3种常用的遗传标记,即核糖体小亚基基因(SSU)、核糖体大亚基基因(LSU)和转录内间隔区(ITS)(包括ITS1、5.8S和ITS2)在区分不同地理株骨条藻中的作用。我们选用分离自威海沿岸6个不同地理水域的2种骨条藻—多恩骨条藻S.dohrnii Sarno et Kooistra和拟中肋骨条藻S.pseudocostatum Medlin emend.Sarno et Kooistra,共25个单克隆藻株为研究对象,分别提取各株骨条藻的DNA,PCR扩增获得SSU、LSU和ITS序列,采用生物学软件计算各采样地点种内分子变异度,分别用3种序列进行系统发育分析,建立并比较进化分枝图。结果显示,同一采样地种内分子变异度较高,进一步确认骨条藻的遗传多样性;3种分子标记均能将不同地理种群的骨条藻加以明显区分,但3种分子标记的区分能力有一定差别,其中ITS的区分能力最强,LSU次之,SSU最差。
【基金】 哈尔滨工业大学(威海)研究基金(HIT(WH)07);哈尔滨工业大学科研创新基金(IM0Q29080006);城市水资源与水环境国家重点实验室开放课题(ES200802)
- 【会议录名称】 庆祝中国藻类学会成立30周年暨第十五次学术讨论会摘要集
- 【会议名称】庆祝中国藻类学会成立30周年暨第十五次学术讨论会
- 【会议时间】2009-11-15
- 【会议地点】中国广东珠海
- 【分类号】Q943
- 【主办单位】中国海洋湖沼学会藻类学分会