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LINE-1 DNA甲基化:鉴别同卵双生个体的潜在遗传标记

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【作者】 徐洁付光平闫丽娜雷亮张晓静付丽红李淑瑾丛斌

【机构】 河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室河北医科大学流行病与卫生统计教研室

【摘要】 目的评估LINE-1序列DNA甲基化鉴别同卵双生子(MZ)的能力及潜在的应用价值。方法按照知情同意原则,收集176对双生子血液样本及64对漱口水样本,提取全基因组DNA,用Goldeneye DNA BASIC试剂盒检测DNA样本的19个常染色体短串联重复序列(STR)基因座分型,确定血液样本中包括119对MZ及57对异卵双生子(DZ),漱口水样本中包括50.对MZ及14对DZ。应用亚硫酸氢盐转化结合焦磷酸测序技术对所有样本LINE-1序列3个CpG位点DNA甲基化进行定量检测,对检测结果进行统计学分析。结果血液样本中3个CpG位点甲基化的平均程度为81.26%、73.91%、74.74%,而漱口水样本中分别为73.18%、69.86%、67.85%,明显低于血液样本;配对t检验结果表明在同一个体血液与漱口水样本中也存在显著差异。15对MZ及10对DZ两个个体之间甲基化水平具有显著差异,分别占MZ及DZ总样本量的12.61%及17.54%。年龄和民族对漱口水样本LINE-1序列3个CpG位点甲基化水平有影响,而对血液样本则无影响,居住地对血液样本LINE-1序列3个CpG位点甲基化水平均无影响。结论 LINE-1序列中的3个CpG位点甲基化可鉴别MZ个体,鉴别能力为12.61%,为解决法医学MZ识别难题提供了初步可行的解决方案,应用时需注意年龄及样本组织来源的影响。

【基金】 国家自然科学基金(30973364);河北省杰出青年科学基金(H2012206103)
  • 【会议录名称】 全国第九次法医学术交流会论文集
  • 【会议名称】全国第九次法医学术交流会
  • 【会议时间】2013-10-23
  • 【会议地点】中国北京
  • 【分类号】D919.2
  • 【主办单位】中国法医学会、公安部物证鉴定中心
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