EB病毒诱发淋巴瘤的宿主细胞基因表达谱分析

【作者】 谢晓利； 唐运莲； 罗春艳； 甘润良；

【机构】 南华大学医学院肿瘤研究所；

【摘要】 EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)与淋巴瘤、鼻咽癌的关系非常密切,被认为是人类肿瘤病毒之一。本实验采用人类全基因组表达谱芯片检测分析EB病毒转化淋巴母细胞和诱发淋巴瘤的宿主细胞基因表达。从健康献血员外周血分离出人淋巴细胞,分别保存正常淋巴细胞,复制体外EBV转化淋巴母细胞模型和在Scid小鼠体内EBV诱发淋巴瘤模型。本实验每例正常人淋巴细胞和EB病毒转化的淋巴母细胞、接种Scid小鼠的人淋巴细胞来源于同一献血员。采用4×44K的Agilent人类全基因组表达谱芯片进行检测,分析比较正常人淋巴细胞与体外EBV转化淋巴母细胞、正常人淋巴细胞与体内EBV诱发淋巴瘤的差异表达基因,筛选出fold change≥2的基因为表达显著上调基因,Fold change<0.5为表达显著下调基因。再用实时定量PCR验证基因芯片检测的结果。对3例同源正常人淋巴细胞(Normal)和体外EBV转化淋巴母细胞(Transform)、2例同源正常人淋巴细胞和Scid小鼠体内EBV诱发淋巴瘤(Tumor)的基因芯片检测结果进行两两比较得出:前者筛选出4821个上调基因,2621个下调基因;后者筛选出2830个上调基因,1550个下调基因。通过对差异表达基因的散点图、Pathway富集、GO富集和层次聚类图分析,均可发现EBV转化淋巴母细胞和EBV诱发淋巴瘤的基因表达模式相似。实时定量PCR检测BCL6和E2F1转录水平改变与基因芯片的检测结果一致。更多还原