云南喀斯特洞穴环境中的可培养放线菌多样性研究

【作者】 程娟； 周恩民； 尹以瑞； 明红； 唐蜀昆； 徐丽华； 李文均；

【机构】 云南大学云南省微生物研究所西南微生物多样性教育部重点实验室； 中国科学院新疆生态与地理研究所中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室；

【摘要】 洞穴是指由岩溶作用形成的人可进入的天然地下空间,是一种典型的喀斯特地貌。洞穴的形成开始于几十万到几亿年前,洞穴内部环境以黑暗,营养和能量贫乏,氧气稀少,温度恒定等为特点。洞穴是一个相对封闭的空间,不易于人类的进入,因此是一个较为原生态的环境,是一个研究微生物资源的绝佳环境。云南有广阔的喀斯特地貌资源,其中有众多发育成熟的洞穴。本研究从云南九乡峡谷公园溶洞、阿庐古洞、建水燕子洞采集滴水、河底沉积物、石花和岩壁土壤样品共19份,选用13种培养基以探索该洞穴环境中的可培养放线菌多样性。从中共分离得到放线菌713株,挑选其中的144株作为代表性菌株,利用16S rRNA基因序列的系统发育分析研究了该地区放线菌的种群多样性。结果显示,这些放线菌分布于8个亚目、17个科、32个属(Actinoalloteichus、Actinocorallia、Actinokineospora、Actinomadura、Agromyces、Alloactinosynnema、Arthrobacter、Brevibacterium、Dietzia、Gordonia、Jiangella、Janibacter、Kocuria、Kribbella、Lentzea、Luteococcus、Microbacterium、Micrococcus、Microlunatus、Micromonospora、Mycobacterium、Nocardia、Nocardioides、Nocardiopsis、Nonomuraea、Polymorphospora、Rhodococcus、Tomitella、Saccharopolyspora、Saccharothrix、Streptomyces、Verrucosispora),其中包括9个潜在新分类单元。本结果表明,洞穴环境中蕴藏着十分丰富的放线菌资源,具有巨大的潜在开发利用价值。更多还原