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杂色鲍Perlucin基因亚型的克隆及分析

Molecular Cloning and Character analysis of Perlucin Subtypes from Haliotis diversicolor

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【作者】 林师王国栋张丽莉邹志华王艺磊

【Author】 Shi Lin,Guodong Wang,Lili Zhang,Zou Zhihua,Yilei Wang (Fisheries College,Jimei University,Xiamen,Fujian,China,361021)

【机构】 集美大学水产学院

【摘要】 Perluicn属于C型凝集素家族,是软体动物特有的一种凝集素。通过检索课题组自建的杂色鲍EST数据库,筛选出perlucin的6条EST,分属不同的亚型。利用SMART RACE技术获得这6条perluicn基因的全长cDNA序列。根据同其它物种序列的相似性分别命名为perlucin 1、perlucin2、perlucin4、perlucin5、perlucin6和perlucin8。并采用Real time PCR和半定量PCR分析这些基因在杂色鲍组织中的表达情况。其中perlucin8比较特殊,具有非常短的ORF仅编码40个氨基酸,等电点约为10.85,偏碱性。其它5条perlucin基因的全长在550bp-760bp之间;开放阅读框编码约160个氨基酸,含有2个二硫键、1-2个糖基化位点和10-14个磷酸化位点;预测蛋白质分子量范围在18-20kDa,等电点范围在4.5-6.0之间。perlucinl基因和perlucin4基因在肝胰腺中特异表达。perlucin5基因在外套膜中的表达量最高,鳃中表达量最低。

【Abstract】 Perlucin belongs to C-lectin family,is speciestypical lectin of mollusk.Six ESTs from H.diversicolor cDNA library was found to be homologous with different perlucin substypes. Subsequently,their full-length cDNAs were obtained by SMART RACE.The six full-length cDNAs were named perlucinl,perlucin2,perlucin4,perlucin5,perlucin6 and perlucin8,according to similarity to other species.Quantitative real-time PCR and semi-quantitative PCR werr employed to investigate the tissue distribution of perlucins mRNA.Perlucin8 has a very short ORF,coding 40 amino acids,with an estimated pI of 10.85.The full length of the other 5 perlucins is 550bp-760bp,encoding about 160 amino acids,with 2 disulfide bonds,1-2 glycosylation sites and 10-14 phosphorylation sites.The predicted molecular weight is 18-20kDa with pI of 4.5-6.0.Perlucinl and perlucin4 express only hepatopancreas.Perlucin5 could be detected in all examined tissues,with the highest espression level in mantle and the lowest in gill.

【关键词】 perlucin基因亚型基因表达杂色鲍
【Key words】 PerlucinGene subtypeGene expressionHaliotis diversicolor
  • 【会议录名称】 渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集
  • 【会议名称】2011年中国水产学会学术年会
  • 【会议时间】2011-11-15
  • 【会议地点】中国福建厦门
  • 【分类号】S917.4
  • 【主办单位】中国水产学会
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