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单基因扰动实验的并行自适应灰关联聚类算法研究

A Parallel Adaptive Algorithm of Parameter Grey Gelation Cluster Analysis for the Single-gene Disturbed Experiment

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【作者】 张轶雯何冰谢江金翊张武

【Author】 ZHANG Yi-wen1,2,HE Bing1,XIE Jiang1,2,JIN Yi1,ZHANG Wu1,2(1 School of Computer Science,Shanghai University,Shanghai 200072,China;2 Institute of Systems Biology,Shanghai University,Shanghai 200444,China)

【机构】 上海大学计算机工程与科学学院上海大学系统生物技术研究所

【摘要】 为有效进行大数据量单基因扰动的生物学实验,基于自适应灰关联聚类算法,提出一个并行自适应灰关联聚类算法,并行处理大数据量的单基因扰动,并建立相应的基因调控网络.计算结果表明,该并行算法具有很好的并行性能.

【Abstract】 To efficiently process large amount of data for single-gene disturbed experiment,which spends the longer time cycle and the higher cost,a parallel adaptive algorithm of parameter grey relation cluster analysis is developed in this paper.The algorithm can deal with massive data for single-gene disturbance,and establish the gene regulatory network.Compared with sequential computing,numerical results of parallel computing show higher performance of both computing scale and time.

【基金】 教育部高等学校博士学科点专项科研基金(200802800007);上海市重点学科建设项目资助基金(J50103)
  • 【会议录名称】 2009年全国开放式分布与并行计算机学术会议论文集(下册)
  • 【会议名称】2009年全国开放式分布与并行计算机学术会议
  • 【会议时间】2009-09-26
  • 【会议地点】中国新疆乌鲁木齐
  • 【分类号】TP301.6
  • 【主办单位】中国计算机学会开放系统专业委员会
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