水稻浆片颖壳化突变体(gll)的鉴定和精细定位

【作者】 于新； 王林友； 张礼霞； 范宏环； 王曦； 金庆生； 王建军； 王才林；

【机构】 浙江师范大学化学与生命科学学院； 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所； 江苏省农业科学院粮食作物研究所江苏省优质水稻工程技术研究中心国家水稻改良中心南京分中心；

【摘要】 鉴定和克隆水稻花器官突变体新基因,对了解水稻花器官发育的分子遗传机理和分子信号调控途径有着重要的作用。本文采用田间种植鉴定、突变体和野生型的花器官对比、杂交后代的表型分离统计及基于图位克隆法的基因定位等方法,对自然突变产生的水稻浆片颖壳化突变体gll(glume-likelodicule,gll)的表现型、遗传特点和基因精细定位开展研究。表型鉴定认为gll突变体小穗上的颖花变异主要表现为浆片颖壳化和外颖增加。分别以野生型籼稻品种引2-3、常规籼稻品种H604和9311、常规粳稻品种日本晴作母本,突变体gll为父本,配制杂交组合,统计F2的表型分离个体,χ2测验结果表明,该突变体表型受1对隐性核基因调控。选取日本晴×gll的F2和F3分离群体中的408株突变表型株作为基因定位群体,以BSA法建成突变体DNA池和野生型DNA池。利用相关网站上公布的505对水稻SSR标记,对gll突变体和日本晴进行标记多态性分析,结果筛选到156对SSR标记在突变体和野生型之间存在多态性。进一步采用这156对标记对突变体DNA池和野生型DNA池进行检测,结果将浆片颖壳化基因GLL定位于水稻第1染色体上SSR标记RM1068和RM3482之间,遗传距离分别为4.6和2.3cM。随后通过搜索获得了4个新的多态性标记,最终将GLL定位于分子标记RM6097和RM6827之间,2个标记间为2个重叠的BAC/PAC克隆,分别为P0506A10和P0035F12,物理距离约为108kb。更多还原