毛冠鹿(Elaphodus cephalophus)SRY基因克隆及进化的研究

【作者】 曹祥荣； 沈玮； 李东霞； 罗红梅；

【机构】 南京师范大学生命科学学院；

【摘要】 SRY基因是哺乳动物染色体上睾丸决定因子的候选基因,SRY基因编码的蛋白质含有与DNA结合的模体,称为HMG盒,其序列在哺乳动物中具有高度的保守性,已应用于多类哺乳动物的分子进化与分子鉴定研究。毛冠鹿(Elaphodus cephalophus,tufted deer)为鹿科,麂亚科,毛冠鹿属动物,其染色体数目介于中等和核型多态性都暗示毛冠鹿可能是鹿科动物染色体进化的过渡类型。本研究采用父系(Y染色体连锁)的SRY基因为标记,根据赤麂的SRY基因序列设计引物,通过PCR反应分别扩增出毛冠鹿、黑麂、小麂的SRY序列,并测得630bp的碱基序列。运用Clustrawl分析软件对所扩增的3种动物及GenBank中登录的赤麂、梅花鹿和牛SRY相应序列进行同源比较,结果显示麂属动物(muntiacs)之间的序列差异为0.79%-1.90%,毛冠鹿属与麂属之间的序列差异为3.02%-3.97%。利用Mega分析软件包中Kimura二参数模型估计彼此间的遗传距离,以牛和梅花鹿的相应SRY为外源,用NJ法和MP法构建SRY基因的系统发生树,结果显示赤麂、黑麂和小麂亲缘近,同属麂属,而毛冠鹿较早与麂属动物分支独立,演进为现存的毛冠鹿单一种群。麂属3种动物之间的分歧时间约为79-190万年,毛冠鹿与麂属动物间的分歧时间约为302-397万年,梅花鹿与麂属动物的分歧时间为349-460万年。以Y染色体上的SRY基因片段序列分析结果与线粒体DNA序列进化分析的聚类结果是一致的,毛冠鹿是现存鹿科动物的中间类型。更多还原