吉陶单极虫(Thelohanellus kitauei)基因组信息揭示了其强大的寄主(鲤鱼)营养剥夺能力

【作者】 杨雅麟； 熊杰； 周志刚； 霍凤敏； 刘玉春； 缪炜； 王蒙； 章晋勇； 王敏； 王磊； 姚斌；

【机构】 中国农业科学院饲料研究所,农业部饲料生物技术重点实验室； 中国科学院水生生物研究所,中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室； 天津生物芯片技术有限责任公司； 南开大学,泰达生物技术学院；

【摘要】 吉陶单极虫(Thelohanellus kitauei)是我国及东北亚地区淡水鲤科鱼类粘孢子虫病的主要病原之一,可引起池塘、水库、湖泊养殖鲤科鱼类大批死亡。缺乏遗传信息是制约控制吉陶单极虫病药物发展的关键。本研究完成了吉陶单极虫基因组及其孢子阶段转录组的测序工作,采用Roche 454和Illumina两种测序平台对吉陶单极虫基因组进行测序,用拼接好的5610个支架组装成一个150.7 Mb的吉陶单极虫基因组序列草图,预测的基因组大小为188.5Mb,注释了16,638个蛋白编码基因。结果表明:①大量的多细胞生物过程基因以及多个多细胞后生动物信号通路基因的存在支持吉陶单极虫是一种多细胞后生动物;②营养特征分析表明吉陶单极虫具有强大的消化蛋白和内吞脂肪的能力,其能量主要是通过有氧代谢的方式获得,具有新颖的几丁质合成基因及合成(代谢)途径;③从2653个孢子阶段高表达基因中筛选到513个已报道药靶的同系物,其中68个与蛋白酶、低密度脂蛋白受体、几丁质合成途径相关酶及其它寄生虫较成熟药靶相关。本研究为吉陶单极虫及其它粘孢子虫的研究提供了大量有价值的数据,为基于营养阻断策略防治吉陶单极虫及其它粘孢子虫病奠定了基础。更多还原