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大黄鱼致病香鱼假单胞菌SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
【机构】 宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室;
【摘要】 根据香鱼假单胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)的rpoD基因序列设计并合成一对特异性引物,经反应体系优化后建立了检测香鱼假单胞菌的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。结果显示,该方法线性关系良好,在Tm为60℃时,扩增产物的熔解曲线仅有单一的特异峰,扩增所得标准曲线为y=-3.448x+42.69,相关系数为0.998;检测灵敏度可达1.9×103copies/μL的DNA含量,与恶臭假单胞菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、创伤弧菌、海藻希瓦氏菌、嗜水气单胞菌、发光假单胞菌、鰤诺卡氏菌和海豚链球菌等不发生交叉反应,具有良好的特异性。应用建立的方法对2012年5月至11月9个批次采集的大黄鱼组织样品进行检测,检出率分析显示与大黄鱼内脏白点病发病季节相吻合。结果表明,建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、敏感、快速、定量等优点,可用于大黄鱼内脏白点病的监测、检测和预防。
【关键词】 香鱼假单胞菌;
rpoD基因;
SYBR-GreenⅠ;
实时荧光定量PCR;
- 【会议录名称】 中国水产学会鱼病专业委员会2013年学术研讨会论文摘要汇编
- 【会议名称】中国水产学会鱼病专业委员会2013年学术研讨会
- 【会议时间】2013-11-05
- 【会议地点】中国海南海口
- 【分类号】S943
- 【主办单位】海南大学、国家大宗淡水鱼类产业技术体系病害防控功能研究室、中国水产学会鱼病专业委员会、中国科学院水生生物研究所