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基于HPLC技术的代谢组学方法发现S180和H22小鼠肿瘤标记物的研究

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【作者】 孙小明刘芸邸多隆吴国泰郭红芸

【机构】 中国科学院西北特色植物资源化学重点实验室甘肃省天然药物重点实验室,兰州化学物理研究所,中国科学院中国科学院研究生院药理教研室,甘肃中医学院甘肃省肿瘤医院甘肃省医学科学院

【摘要】 天然产物化学研究中,亟需具有高通量的活性筛选方法,然而由于目前已知筛选模型有限,因此高通量目标很难实现。该论文目的在于,通过评价由肿瘤细胞干预产生的代谢紊乱,进而找到潜在生物标记物。采用HPLC-DAD技术建立了小鼠血浆代谢指纹图谱,方法学评价证明其稳定性和精密度良好。采用主成分分析(PCA)和偏最小二乘-判别分析(PLS-DA)多元统计分析方法寻找代谢物差异并找到潜在生物标记物。紫杉醇用于体内抗S180和H22肿瘤活性研究,肿瘤生长抑制率作为评价指标,此数据作为已建立模型的验证数据。最后,对标记物色谱数据和肿瘤抑制率进行偏最小二乘相关分析。结果表明,建立的代谢指纹图谱平均相似度在0.8以上,建立的S180和H22两组化学计量学模型的预测率分别为97.3%和100%。最终分别发现包括尿酸和胞嘧啶核苷在内的9个(S180)和7个(H22)潜在生物标记物。生物标记物的色谱数据和肿瘤抑制率数据具有显著相关性(P<0.05)。该研究表明,基于HPLC技术的代谢组学方法发现生物标记能够更清楚的明确机体的生理病理改变。建立的化学计量学模型具有良好的预测能力,可用于后期的药物活性高通量的筛选。

  • 【会议录名称】 西北地区第六届色谱学术报告会甘肃省第十一届色谱年会论文集
  • 【会议名称】西北地区第六届色谱学术报告会甘肃省第十一届色谱年会
  • 【会议时间】2010-06-01
  • 【会议地点】中国甘肃兰州
  • 【分类号】R73-3
  • 【主办单位】甘青宁色谱协作中心、甘肃省化学会色谱专业委员会
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