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十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析
【作者】 程影； 黄锐芝； 钟新民； 吴学龙； 王五宏； 刘智宏； 李必元；
【机构】 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室； 浙江省农业科学院蔬菜研究所； 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所浙江省植物代谢基因工程试验基地；
【摘要】 <正>采用PCR克隆技术,根据已报道的拟南芥的AtHSP22.0基因全长及其它物种同源序列设计特异引物,在十字花科植物大白菜、青菜、甘蓝型油菜CY、花椰菜、荠菜、芥菜、萝卜、芥菜型油菜川黄中克隆得到耐热相关基因AtHSP22.0的同源序列。测序得到的各物种的HSP22基因核苷酸序列,同GenBank中搜索获得拟南芥序列和亲缘关系较远的单子叶植物玉米的HSP22基因序列进行多序列联配。对得到的比对结果用MEGA4.0软件构建NJ系统树。相应氨基酸结构域及特性用ExPasy在线分析。二级结构用Bioinformatics&Biological computing在线分析。三维模型通过SWISS-MODEL完成。用MOLMOL对蛋白质的三级结构中多肽段定位,并绘制三级结构图。
【基金】 国家高技术研究发展计划(863)项目(2008AA02Z103);浙江省农科院科技创新项目
- 【会议录名称】 中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集
- 【会议名称】中国园艺学会2011年学术年会
- 【会议时间】2011-10-19
- 【会议地点】中国安徽合肥
- 【分类号】S184
- 【主办单位】中国园艺学会(Chinese Society for Horticultural Science)、中国农业科学院蔬菜花卉研究所(Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences)