利用SNP标记分析花梅与果梅品种遗传关系的研究(摘要)

【作者】 李晓颖； 王晨； 蔡斌华； 房经贵； 章镇；

【机构】 南京农业大学园艺学院；

【摘要】 以68个梅品种(花梅品种36个及果梅品种32个)为材料,利用SNPs标记对梅的遗传多样性和亲缘关系进行了研究。以每个品种的DNA为模板,利用9对引物扩增获得了总长度均为2,916bp的基因组序列,获得多态性SNP位点92个,分布密度为1SNP/32bp,包括:51个转换(55.4%),34个颠换(37%),4个缺失或插入(4.4%),3个其它类型(3.3%)。本研究对花梅和果梅的SNP进行了统计:花梅SNP总数为50,密度为1SNP/58bp;而果梅中总数为72,密度为1SNP/41bp,果梅SNP的出现频率高于花梅,说明果梅品种间的遗传差异较大,也可能是由于这些花梅品种的育种亲本相似或者地理起源相近。根据92个SNPs位点多态性资料,应用PHYLIP程序中的邻位相连法构建了花梅和果梅的系统进化树。结果表明:所有梅品种并没有形成花梅和果梅形式的两大组群,说明果梅与花梅在遗传上具有很高的相似性,是同一树种中某些性状(主要是花器官)存在一定差异的不同品种类型。上述系统进化树将供试68份品种资源分成11个群体,包括5个花梅组群,2个果梅组群,4个花果混合群。至于果梅或花梅小组群的存在,可能由于这些小组群中的品种来源的相似性而具有较近的亲缘关系。本研究结果表明,尽管花梅和果梅的用途以及花性状上的明显差异,但它们在梅的进化来源以及遗传分析方面具有同等的重要性。更多还原