利用甘蓝型油菜高密度SNP遗传图谱定位角果相关性状QTL位点

【作者】 王会； 梅德圣； 李云昌； 刘佳； 王军； 汪文祥； 付丽； 桑世飞； 胡琼；

【机构】 中国农业科学院油料作物研究所国家油料作物改良中心,农业部油料作物遗传改良重点实验室；

【摘要】 油菜是我国重要的油料作物,提高产量是油菜产业当前面临的主要问题。油菜角果做为贮藏菜籽的器官,其一系列的性状对于油菜产量的提高具有重要的作用,比如角果长、每角粒数、角果籽粒密度、每角粒重等性状。油菜60K SNP芯片包含52157个SNP位点,可快速、高通量对油菜进行基因型分型,为油菜性状的遗传定位研究带来莫大的便利。本研究利用油菜60K SNP芯片对DH群体进行基因型分型后构建高密度遗传图谱,以此对油菜角果相关的一系列重要性状进行QTL定位研究。结果显示,高密度SNP遗传图谱共包括1978个SNP标记,分布于油菜19条连锁群上,覆盖甘蓝型油菜基因组1879.3cM。在两年两点四个环境中,共检测到29个角果长QTL位点,解释表型变异1.18%-49.54%,其中主效位点BnqSLA09-1在三个环境下同时检测到,分别解释表型变异32.85%、28.43%和49.54%,另一主效位点BnqSLA09-2在两个环境下同时检测到,分别解释表型变异47.96%和21.58%;共检测到23个每角粒数QTL位点,解释表型变异5.07%-34.51%,其中BnqSSC09和BnqSSC06两个位点分别在两个环境下同时检测到,BnqSSC09分别解释表型变异7.76%和16.18%,BnqSSC06分别解释表型变异23.28%和20.00%;共检测到26个角果籽粒密度QTL位点,解释表型变异3.52%-50.11%,其中BnqGDSA09和BnqGDSC06两个位点分别在两个环境下同时检测到,BnqGDSA09分别解释表型变异29.17%和40.43%,BnqGDSC06分别解释表型变异13.42%和14.57%。在一年两点两个环境中,共检测到9个每角粒重QTL位点,解释表型变异2.85%-11.88%。本研究通过利用油菜60K SNP芯片构建的高密度遗传图谱成功对油菜角果相关性状进行了QTL定位,显示该SNP芯片在油菜遗传定位研究中的优越性,同时对角果相关的一系列性状QTL定位为这些性状的精细定位奠定基础,为油菜产量的提高提供帮助。更多还原