南方汉族群体Y-STR和Y-SNP系统的研究和法医学应用

【作者】 任贺；

【导师】 王英元；

【作者基本信息】 山西医科大学 ， 法医学， 2007， 硕士

【摘要】 目的:Y染色体多态性DNA遗传标记可以追溯人类的起源和进化。越来越多的人类学家,应用Y染色体多态性DNA遗传标记,通过计算不同群体间的遗传距离和进行聚类分析,来揭示不同群体的起源、进化、迁移和亲缘关系。同时在法医学实践中,Y染色体DNA分析研究结果,可提高性犯罪案中混合斑迹男性物质的分离率,父系亲属间亲权关系鉴定,增加个人识别能力和非父排除能力,具有独特优势。本研究还为保存、丰富中国南方汉族的基因提供了信息资源。方法:本研究选择了DYS19,DYS389Ⅰ,DYS389Ⅱ,DYS390,DYS391,DYS392,DYS393,DYS385a,b,DYS437,DYS438和DYS439共计11个Y-STR基因座,应用PCR扩增和毛细管电泳分离,得到Y-STR基因座分型。并从YCC系统树中的几个主要分支选择了92R7、M103、M110、M111、M117、M119、M120、M122、M128、M130、M134、M139、M159、M15、M168、M175、M176、M178、M17、M214、M217、M231、M3、M45、M5、M50、M60、M7、M8、M88、M89、M9、M91、M95、M98、RPS4Y、SRYl532等37个SNP片段,应用PCR扩增直接测序方法得到38个SNP位点。研究了我国南方汉族50个样本的Y-STR和Y-SNP扩展单倍型。并应用统计学方法与50个北方汉族样本的结果进行比较。结果:获得了南方汉族Y-STR和Y-SNP的等位基因及单倍型频率多态性分仃资料。50个男性无关个体,共检测到了48种单倍型。11个Y-STR基因座共检测到47种单倍型及2/1个等位基因,基因频率分布在0.02-0.68之间,基因多样性值(GD)分布在0.4772-0.9526之间;38个SNP位点共检测到18种单倍型。结论:直接测序法可以测定序列中的单个碱基,十分准确、清晰的反应出变异,大大增强了结果的分析性和可靠性,为法医学混合斑中男性成分的个体识别和父系亲缘关系鉴定提供了新的技术方法,具有实用价值。统计结果数据表明,北方汉族与南方汉族在Y染色体遗传基因上的遗传距离较远。这对于进一步开发、利用中国汉族遗传信息资源,具有广泛的意义。更多还原

【Abstract】 Objective:In the last few years,human Y chromosome polymorphisms are increasingly interested by scientists,not only for population genetics or evolutionary studies but also for forensic application.More and more anthropologists study human migration and evolution by comparing the genetic distance and clustering different populations using Y-chromosomal polymorphic genetic marker.The considerable interest is the potential ability of Y-chromosome analysis to unravel the race and ethnic background of a given DNA profile.The results of this study preserved and enriched south Chinese Han ethnical gene informational resources.Method:We co-amplified DYS19,DYS389Ⅰ,DYS389Ⅱ,DYS390,DYS391,DYS392, DYS393,DYS385a,b,DYS437,DYS438,DYS4391 STR loci and 92R7,M103,M110,M111, M117,M119,M120,M122,M128,M130,M134,M139,M159,M15,M168,M175, M176,M178,M17,M214,M217,M231,M3,M45,MS,MS0,M60,M7,MS,M88, M89,M9,M91,M95,M98,RPS4Y,SRY1532 SNP markers from YCC.We investigated 50 unrelated male individuals of Southern Han individuals.Result:Among the 50 individuals,48 haplotypes were detected.For STR markers,47 alleles and 24 haplotypes were detected,with allele frequency and gene diversity ranging from 0.02-0.68, 0.4775-0.9526.18 haplotypes were detected in 38 SNP loci.Conclusion:The result showed that the studied Northen Han in China while indicated significantly differences with Southern Han.In order to study the allelic frequency distribution and haplotype diversity of Y-chromosomal STR and SNP loci of Chinese southern population, evaluate their usefulness in forensic paternity testing and human identification,and carry out Chinese population genetic analysis.更多还原